Asociación del umbral de ciclos (Ct) en prueba RT-PCR para SARS-CoV-2 y severidad de la COVID-19 en pacientes de un hospital de referencia en Paraguay

Autores/as

DOI:

https://doi.org/10.18004/mem.iics/1812-9528/2022.020.01.53

Palabras clave:

SARS-CoV-2, carga viral, enfermedad grave; números de ciclos (Ct)

Resumen

Algunos estudios han encontrado que la severidad de la COVID-19 se asocia con una alta carga viral determinada por los números de ciclos (Ct) de amplificación de ADN de SARS-CoV-2. El objetivo fue determinar la relación entre el umbral de ciclos de PCR de SARS-CoV-2 y la severidad de la infección por el virus SARS-COV-2 en pacientes internados y ambulatorios en un hospital de referencia entre marzo a junio del 2021. Estudio retrospectivo observacional analítico de corte trasverso de pacientes adultos con COVID-19, ambulatorios e internados en el Hospital Nacional. Se incluyeron los pacientes cuya infección fue confirmada por RT-PCR para SARS-CoV-2, se consideró un punto de corte para Ct<25. Se estudiaron 517 pacientes entre 16 a 98 años de edad (media ± DE: 51,5±17,5), 268 varones (51,8%), edad >60 años (36,6%), estuvieron hospitalizados (69,8%), internados en sala (57,1%), y admitidos en cuidados intensivos (12,8%), tiempo medio de enfermedad 8,48 ± 4,2 días. La mortalidad fue de 22,2%. Se encontró mayor riesgo de fallecer para los pacientes con Ct <25 tanto para el gen E (OR: 1.61; IC95%: 1,06-2,44) como para el N2 (OR: 1.83; IC95%: 1,19-2,80) y con edad >60 años (OR: 3,69; IC95%: 2,39-5,68). Estos dos factores permanecieron asociados con el óbito en el análisis multivariado. Hubo mayor riesgo de hospitalizarse y fallecer en los pacientes con Ct<25. El valor Ct podría ser útil para la predicción del curso clínico y el pronóstico de los pacientes con COVID-19.

Descargas

Los datos de descargas todavía no están disponibles.

Citas

Zhu N, Zhang D, Wang W, Xingwang Li X, Yang B, Song J. China Novel Coronavirus Investigating and Research Team A Novel Coronavirus from Patients with Pneumonia in China, 2019. N Engl J Med 2020; 382: 727-33. 10.1056/NEJMoa2001017.

Li Q, Guan X, Wu P, Wang X , Lei Zhou L , Tongl Y. Early Transmission Dynamics in Wuhan, China, of Novel Coronavirus-Infected Pneumonia. N Engl J Med 2020; 382: 1199-207.10.1056/NEJMoa2001316.

Wang D, Hu B, Hu C, Zhu F, Liu X, Zhang J, et al. Clinical Characteristics of 138 Hospitalized Patients with 2019 Novel Coronavirus-Infected Pneumonia in Wuhan, China. JAMA. 2020; 323(11): 1061-9. Doi: 10.1001/jama.2020.1585

Organización Mundial de la Salud. Alocución de apertura del director general de la OMS en la rueda de prensa sobre la COVID-19 celebrada el 11 de marzo de 2020 2020. Disponible en: https://www.who.int/es/dg/speeches/detail/who-director-general-s-opening-remarks-at-the-media-briefing-on-covid-19---11-march-2020

Casas-Rojo JM, Antón-Santos JM, Millán-Núñez-Cortés J, Lumbreras-Bermejo C, Ramos-Rincón JM, Roy-Vallejo E, et al. Características clínicas de los pacientes hospitalizados con covid-19 en España: resultados del registro semi-covid-19. Rev Clin Esp. 2020; 220(8). Doi: 10.1016/j.rce.2020.07.003 [

Grasselli G, Zangrillo A, Zanella A, Antonelli M, Cabrini L, Castelli A, et al. Características basales y resultados de 1591 pacientes infectados con SARS-CoV-2 ingresados en UCI de la región de Lombardía, Italia. JAMA. 2020; 323 (16): 1574-81. Doi: 10.1001/jama.2020.5394

Araujo M, Ossandón P, Abarca AM, Menjiba AM, Muñoz AM. Pronóstico de pacientes hospitalizados por COVID-19 en un centro terciario en Chile: estudio de cohorte. Medwave. 2020; 20(10): e8066. Doi: 10.5867/medwave.2020.10.8066

Rearte A, Baldani AEM, Barcena Barbeira P, Domínguez CS, Laurora MA, Pesce M, et al. Características epidemiológicas de los primeros 116 974 casos de COVID-19 en Argentina, 2020. Rev. Argent. Salud Pública. 2020; 12 (Suppl 1): 5-5. Disponible en: http://www.scielo.org.ar/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1853-810X2020000300005&lng=es

Suleyman G, Fadel RA, Malette KM, Hammond C, Abdulla H, Entz A, et al. Clinical Characteristics and Morbidity Associated With Coronavirus Disease 2019 in a Series of Patients in Metropolitan Detroit. JAMA Netw Open. 2020; 1; 3(6): e2012270. Doi: 10.1001/jamanetworkopen.2020.12270

Argenziano MG, Bruce SL, Slater CL, Tiao JR, Baldwin MR, Barr RG, et al. Characterization and clinical course of 1000 patients with coronavirus disease 2019 in New York: retrospective case series. BMJ. 2020 May 29; 369: m1996. doi: 10.1136/bmj.m1996

Vargas-Correa A, Mereles EF, Segovia Coronel N, Giménez Ayala A, Santacruz L, Ojeda ML, et al. Características clínico-epidemiológicas de pacientes confirmados con COVID-19 del Departamento de Alto Paraná, Paraguay. Rev. Salud Pública Parag. 2021; 11(1): 54-61. Disponible en: http://revistas.ins.gov.py/index.php/rspp/article/view/9

Rios-González CM, Rolón-Ruiz Diaz AR, Espinola-Canata M, Battaglia A, Mayeregger E. Comportamiento clínico y epidemiológico de pacientes internados por COVID-19 en un Hospital de Contingencia para COVID-19 de Paraguay, 2020. Rev. salud publica Parag. [Internet]. 2021 Jun; 11(1): 62-6. Doi: 10.18004/rspp.2021.junio.62

Sobarzo P, Rolón López JC, Narváez Serra PF, López Cañete SA. Características clínicas de los primeros 60 pacientes con SARS CoV-2 internados en el Hospital Nacional periodo junio-agosto 2020. Rev. virtual Soc. Parag. Med. Int. 2021; 8(1): 69-77. Doi: 10.18004/rvspmi/2312-3893/2021.08.01.69

Montiel D, Torres E, Acosta A, Sobarzo P, Pérez H, Ávalos D, et al. Características clínicas, laboratoriales y predictores de mortalidad de pacientes con COVID-19 internados en el Hospital Nacional. Rev. cient. cienc. salud. 2021; 3(1):26-37.

Wolters F, Van de Bovenkamp J, Van den Bosch B, Van den Brink S, Broeders M, Chung-Hoa N, et al. Multicenter evaluation of cepheid xpert(r) xpress SARS-CoV-2 point-of-care test during the SARS-CoV-2 pandemic. Journal of Clinical Virology [Internet] 2020 [citado 14 mayo 2020]; 128(Julio 2020): 104426. Doi: 10.1016/j.jcv.2020.104426

Rainer TH, Lee N, Ip M, Galvani AP, Antonio GE, Wong KT, et al. Features discriminating SARS from other severe viral respiratory tract infections. Eur J Clin Microbiol Infect Dis 2007; 26: 121-9. Doi: 10.1007/s10096-006-0246-4.

Zaki AM, van Boheemen S, Bestebroer TM, Osterhaus AD, Fouchier RA. Isolation of a novel coronavirus from a man with pneumonia in Saudi Arabia. N Engl J Med 2012; 367: 1814-20. Doi: 10.1056/NEJMoa1211721.

Memish ZA, Al-Tawfiq JA, Makhdoom HQ, Assiri A, Alhakeem RF, Albarrak A, et al. Respiratory tract samples, viral load, and genome fraction yield in patients with Middle East respiratory syndrome. J Infect Dis 2014; 210: 1590-4. Doi: 10.1093/infdis/jiu292.

Bai Y, Yao L, Wei T, Tian F, Jin DY, Chen L, et al. Presumed asymptomatic carrier transmission of COVID-19. JAMA 2020; 323 (14): 1406-7. Doi: 10.1001/jama.2020.2565.

To KK, Tsang OT, Leung WS, Tam AR, Wu TC, et al. Temporal profiles of viral load in posterior oropharyngeal saliva samples and serum antibody responses during infection by SARS-CoV-2: an observational cohort study. Lancet Infect Dis 2020; 20 (5): 565-74. doi: 10.1016/S1473-3099(20)30196-1.

Mizumoto K, Kagaya K, Zarebski A, Chowell G. Estimating the asymptomatic proportion of coronavirus disease 2019 (COVID-19) cases on board the Diamond Princess cruise ship, Yokohama, Japan, 2020. Euro Surveill 2020; 25(10): 2000180. Doi: 10.2807/1560-7917.ES.2020.25.10.2000180.

Zou L, Ruan F, Huang M, Liang L, Huang H, Hong Z, et al. SARS-CoV-2 Viral Load in Upper Respiratory Specimens of Infected Patients. N Engl J Med 2020; 382: 1177-9. 10.1056/NEJMc2001737.

Liu Y, Yan LM, Wan L, Xiang TX, Le A, Liu JM, et al. Viral dynamics in mild and severe cases of COVID-19. Lancet Infect Dis 2020; 20 (6): 656-657. Doi: 10.1016/S1473-3099(20)30232-2.

Young BE, Ong SWX, Kalimuddin S, Low JG, Tan SY, Loh J, et al. Epidemiologic features and clinical course of patients infected with SARS-CoV-2 in Singapore. JAMA 2020; 323 (15): 1488-94. Doi: 10.1001/jama.2020.3204

Chang L, Yan Y, Wang L. Coronavirus disease 2019: coronaviruses and blood safety. Transfus Med Rev 2020; 34 (2):75-80.

Huang C, Wang Y, Li X, Ren L, Zhao J, Hu Y, et al. Clinical features of patients infected with 2019 novel coronavirus in Wuhan, China. Lancet 2020; 395 (10223): 497-506.

Backer JA, Klinkenberg D, Wallinga J. Incubation period of 2019 novel coronavirus (2019-nCoV) infections among travellers from Wuhan, China, 20- 28 January 2020. Euro Surveill 2020; 25 (5): 2000062. Doi: 10.2807/1560-7917.ES.2020.25.5.2000062.

Magleby R, Westblade LF, Trzebucki A, Simon MS, Rajan M, Park J. Impact of Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus 2 Viral Load on Risk of Intubation and Mortality Among Hospitalized Patients With Coronavirus Disease 2019. Clin Infect Dis. 2020:ciaa851. Clin Infect Dis 2021 Dec 6; 73(11): e4197-e05. Doi: 10.1093/cid/ciaa851.

Rao D, Manissero VR, Steele J, Pareja SN. A Systematic Review of the Clinical Utility of Cycle Threshold Values in the Context of COVID-19. Infect Dis Ther 2020 Sep; 9(3): 573-86. Doi: 10.1007/s40121-020-00324-3

Huang JT, Ran RX, Lv ZH, Li-Na Feng LN, Ran CY, Tonget YO, et al. Chronological changes of viral shedding in adult inpatients with COVID-19 in Wuhan, China. Clin Infect Dis. 2020; ciaa631.

Yu XS, Sun S, Shi Y, Wang H, Zhao R, Sheng J. SARSCoV-2 viral load in sputum correlates with risk of COVID-19 progression. Crit Care. 2020; 24: 170.

Zheng SF, Fan J, Yu F, Feng B, Bin L, Qianda Z, et al. Viral load dynamics and disease severity in patients infected with SARS-CoV-2 in Zhejiang province, China, January-March 2020: retrospective cohort study. BMJ. 2020; 369: m1443.

Rhoads D, Peaper DR, She RC, Nolte FS, Wojewoda CM, Anderson NW, Pritt BS. College of American Pathologists (CAP) Microbiology Committee Perspective: Caution Must Be Used in Interpreting the Cycle Threshold (Ct) Value. Clin Infect Dis. 2021; 72(10): e685-e686. doi: 10.1093/cid/ciaa1199.

Scola B La, Le Bideau M, Andreani J, Hoang VT, Grimaldier C, Colson P, et al. Viral RNA load as determined by cell culture as a management tool for discharge of SARS-CoV-2 patients from infectious disease wards. Eur J Clin Microbiol Infect Dis. 2020; 39(6): 1059-61. Doi: 10.1007/s10096-020-03913-9

Wölfel R, Corman VM, Guggemos W, Seilmaier M, Zange S, Müller MA, et al. Virological assessment of hospitalized patients with COVID-2019. Nature [Internet]. 2020; 581: 465-9. Available from: Doi: 10.1038/s41586-020-2196-x

McNaughton CD, Adams NM, Johnson CH, Ward MJ, Lasko TA. Diurnal variation in SARS-CoV-2 PCR test results: Test accuracy may vary by time of day. Med Rxiv. 2021 Doi: 10.1101/2021.03.12.21253015.

Stephen KM, Fauver JR, Mack C, Tai CG, Breban MI, Watkins AE. Densely sampled viral trajectories suggest longer duration of acute infection with B.1.1.7 variant relative to non-B.1.1.7 SARS-CoV-2. 2021. Doi: 10.1101/2021.02.16.21251535

Dahdouh E, Lázaro-Perona F, Romero-Gómez MP, Mingorance J, García-Rodriguez J. Ct values from SARS-CoV-2 diagnostic PCR assays should not be used as direct estimates of viral load. J Infect. 2020; 82: 426-8. Doi: 10.1016/j.jinf.2020.10.017.

Romero-Gómez MP, Gómez-Sebastián S, Cendejas-Bueno E, Montero-Vega MD, Mingorance J, García-Rodríguez J. Ct value is not enough to discriminate patients harbouring infective virus. J Infect. 2020; 82: e35-7. doi: 10.1016/j.jinf.2020.11.025.

Descargas

Publicado

2022-04-01

Cómo citar

Montiel, D., Torres, E., Samudio, M., López, M., Duarte, L., Sobarzo Vysokolán, P. M., Zárate, D., Duarte, P. E., Dávalos Ortiz, J. C., Torres, M., & Gómez Páez, L. L. (2022). Asociación del umbral de ciclos (Ct) en prueba RT-PCR para SARS-CoV-2 y severidad de la COVID-19 en pacientes de un hospital de referencia en Paraguay. Memorias Del Instituto De Investigaciones En Ciencias De La Salud, 20(1), 53–63. https://doi.org/10.18004/mem.iics/1812-9528/2022.020.01.53

Número

Sección

Articulos Originales

Artículos más leídos del mismo autor/a

<< < 1 2 3 4 5 6 7 > >>