Molecular identification of respiratory viruses in Itapúa, Paraguay during the year 2023

Karina Cáceres Fernández; Ramona Morales Rivé; Sandra Caballero Gómez

doi:10.18004/mem.iics/1812-9528/2024.e22162404

Sobre la Revista

La revista Memorias del Instituto de Investigaciones en Ciencias de la Salud (Mem. Inst. Investig. Cienc. Salud) es el órgano oficial de publicación del Instituto de Investigaciones en Ciencias de la Salud (IICS) de la Universidad Nacional de Asunción (UNA), Paraguay. Publica contribuciones científicas originales en medicina clínica, investigación biomédica, microbiología, biología molecular, odontología, enfermería, nutrición, salud pública, biotecnología en salud, genética, bioquímica y otras disciplinas relacionadas. Fundada en 1983, adoptó su nombre actual en 2002 y desde 2015 se publica exclusivamente en línea, incorporando a partir de 2024 la difusión de artículos en formato XML. Desde 2023 opera bajo el sistema de publicación en flujo continuo. Recibe manuscritos en español e inglés en las modalidades de artículos originales, revisiones, estudios de caso y comunicaciones breves. Todo su contenido es de acceso abierto, sin cargos para autores ni lectores, bajo la Licencia Creative Commons Atribución 4.0 Internacional, en concordancia con la Budapest Open Access Initiative (BOAI). Está indexada en BVS, SciELO Paraguay, HINARI, LILACS, DOAJ, Latindex, MIAR, Dialnet, CiteFactor, Google Scholar, LivRe, BASE, EBSCO y Web of Science – SciELO Citation Index. Su publicación es financiada por el IICS-UNA, incorpora el protocolo OAI-PMH para la recolección de metadatos y utiliza el sistema LOCKSS para la preservación digital de sus contenidos.

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Molecular identification of respiratory viruses in Itapúa, Paraguay during the year 2023

Autores/as

Karina Cáceres Fernández Universidad Autónoma de Encarnación. Facultad de Ciencias Químicas y Farmacéuticas. Paraguay https://orcid.org/0000-0002-6535-2184
Ramona Morales Rivé Universidad Autónoma de Encarnación. Facultad de Ciencias Químicas y Farmacéuticas. Paraguay https://orcid.org/0009-0000-9463-1812
Sandra Caballero Gómez Universidad Autónoma Encarnación, Hospital Regional de Encarnación. Paraguay https://orcid.org/0000-0003-3468-5557

DOI:

https://doi.org/10.18004/mem.iics/1812-9528/2024.e22162404

Palabras clave:

Infecciones Respiratorias, Virus Sincitiales Respiratorios, PCR en Tiempo Real, diagnóstico molecular

Resumen

Las Infecciones Respiratorias Agudas (IRA) constituyen un importante problema de salud, pues representan una de las primeras causas de atención médica en todo el mundo, tanto en la consulta ambulatoria como en la internación y se encuentran entre las primeras causas de mortalidad. El objetivo fue detectar e identificar agentes virales causantes de IRA por técnicas moleculares en muestras respiratorias procesadas en el laboratorio de Biología Molecular del Hospital Regional de Encarnación (HRE), Itapúa. Se realizó un estudio descriptivo, transversal y cuantitativo de 394 muestras respiratorias recolectadas entre abril y agosto del 2023, aplicando un panel multiplex por Reacción en Cadena de la Polimerasa en Tiempo Real (qPCR). Se analizaron variables como sexo, edad, distrito de procedencia; clínica, Enfermedad tipo influenza (ETI) o Infección Respiratoria Aguda Grave (IRAG) y patógeno viral detectado. En el 55,08% se detectó algún virus. Los virus más frecuentes fueron Virus Sincitial Respiratorio (VSR) (53,92%) y Rinovirus (RV) (23,96%). La mayoría de los pacientes con Infección Respiratoria Viral (IRV) fueron niños menores de 2 años (49,31%). El VSR predominó en los meses de mayo y junio en pacientes hospitalizados por IRAG (64,06% n= 89) y los distritos con mayor frecuencia de IRV fueron Encarnación y Cambyreta (59,91% y 17,05%, respectivamente). El VRS fue la principal causa de hospitalización por IRAG en menores de dos años en Itapúa durante mayo y junio, destacando la importancia de priorizar a los niños en riesgo y de ampliar los estudios a otras etiologías.

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Referencias

1. Estrada García CB, Recio Fornaris I, Martínez Orozco D, Collejo Rosabal YM, Mariño Serrano RY. Caracterización epidemiológica de las infecciones respiratorias agudas graves. Granma, marzo-mayo de 2020. Rev Med (Puebla). 2020; 24(6): 1242–57. Disponible en: http://scielo.sld.cu/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1028-48182020000601242

2. Vizzotti C, Tirado SM, Grinblat N, Molina V, Pagano I, Strella T, et al. Guía para la vigilancia epidemiológica y recomendaciones para la prevención y control de las infecciones respiratorias agudas. [Internet]. 2023 [citado el 3 de enero de 2024]. Disponible en: https://bancos.salud.gob.ar/sites/default/files/2023-05/guia-vigilancia-ira_2023.pdf

3. Margarita M, Milián L, Méndez López M, Méndez López L, Garaguey AN. Infecciones respiratorias agudas: breve recorrido que justifica su comportamiento. Rev Inf Cient. 2016; 95(2): 339–55. Disponible en:

https://revinfcientifica.sld.cu/index.php/ric/article/view/114/1463

4. Martínez P, Pérez Martínez C, Rodríguez Toribio A, Jesús L, Martín P, Jesús J, et al. Comportamiento de las infecciones respiratorias agudas en un consultorio médico Behavior of acute respiratory infections in a medical office [Internet]. Vol. 14. 2018. Disponible en: https://revgaleno.sld.cu/index.php/ump/rt/printerFriendly/291/html

5. Pichler K, Assadian O, Berger A. Viral respiratory infections in the neonatal intensive care unit-a review. Front Microbiol. el 19 de octubre de 2018. Disponible en: https://www.frontiersin.org/journals/microbiology/articles/10.3389/fmicb.2018.02484/full

6. Vila J, Gómez MD, Salavert M, Bosch J. Métodos de diagnóstico rápido en microbiología clínica: necesidades clínicas. Enferm Infecc Microbiol Clin. el 1 de enero de 2017; 35(1): 41–6. DOI: 10.1016/j.eimc.2016.11.004.

7. Sanbonmatsu-Gámez S, Pérez-Ruiz M, Lara-Oya A, Pedrosa-Corral I, Riazzo-Damas C, Navarro-Marí JM. Analytical performance of the automated multianalyte point-of-care mariPOC® for the detection of respiratory viruses. Diagn Microbiol Infect Dis. el 1 de noviembre de 2015; 83 (3): 252–6. DOI: 10.1016/j.diagmicrobio.2015.07.010.

8. Marimón JM, Navarro-Marí JM. Métodos de diagnóstico rápido de las infecciones respiratorias. Enferm Infecc Microbiol Clin [Internet]. el 1 de febrero de 2017 [citado el 8 de enero de 2024]; 35(2): 108–15. Disponible en:

https://linkinghub.elsevier.com/retrieve/pii/S0213005X16303871

9. Díaz-Chiguer DL, Tirado-Mendoza R, Márquez-Navarro A, Ambrosio-Hernández JR, Ruiz-Fraga I, Aguilar-Vargas RE, et al. Detección y caracterización molecular de virus respiratorios causantes de infección respiratoria aguda en población adulta. Gac Med Mex. el 1 de junio de 2019; 155: S16–21. Disponible en:

https://doi.org/10.24875/gmm.19005138

10. Pérez-Ruiz M, Pedrosa-Corral I, Sanbonmatsu-Gámez S, Navarro-Marí JM. Laboratory Detection of Respiratory Viruses by Automated Techniques. Open Virol J. 2012; 7(1): 151–9. DOI: 10.2174/1874357901206010151

11. Véliz-Castro T, Mendoza KA, Arteaga Desireth YP, Clavijo Mereida J, Valero-Cedeño. Epidemiología de las infecciones respiratorias y sus factores predisponentes en adultos del cantón Jipijapa. Dom Cien. 2021; 7(4): 892–914. Disponible en: https://dialnet.unirioja.es/servlet/articulo?codigo=8383945

12. Vigilancia Universal IRAS y ETI. Planilla semanal de notificación obligatoria: VENOCD., Vigilancia Centinela de ETI e IRAG: Laboratorio Central de Salud Pública (LCSP), Laboratorios Regionales y de Hospitales Centinelas dependientes de la Red Nacional de Laboratorios. Alerta Epidemiologica Nro 5. 2023.

13. Organización Panamericana de la Salud (OPS), Organización Mundial de la Salud (OMS). Alerta epidemiológica Inicio anticipado del incremento de la actividad de virus respiratorios [Internet]. 2023. Disponible en: http://epi.minsal.cl/

14. Ministerio de Salud de Argentina. BOLETÍN EPIDEMIOLÓGICO NACIONAL. Semana Epidemiológica 36 [Internet]. 2023 sep. Disponible en: https://bancos.salud.gob.ar/sites/default/files/2023-09/ben-670_se37.pdf

15. Ministerio de Salud de Argentina. BOLETÍN EPIDEMIOLÓGICO NACIONAL. Semana Epidemiológica 37 [Internet]. 2023 sep. Disponible en: https://www.argentina.gob.ar/sites/default/files/2024/04/ben_670_se_37.pdf

16. Ministerio de Salud Argentina. Circulación de Influenza, VSR y otros virus respiratorios. 2023 jun. Disponible en: https://bancos.salud.gob.ar/sites/default/files/2023-06/comunicacion-influenza-ovr-06-2023.pdf

17. Ministerio de Salud de Chile. Informe virus respiratorios Campaña Invierno 2023 [Internet]. Santiago; 2023. Disponible en: https://www.minsal.cl/informe-virus-respiratorios-campana-invierno-2023/

18. Dirección General de Vigilancia Sanitaria (DGVS). Alerta Epidemiológica N° 4. Aumento de consultas por Enfermedad Tipo Influenza (ETI). 2023 abr. Disponible en: https://dgvs.mspbs.gov.py/wp-content/uploads/2023/05/Alerta-Epidemiologica-Nro-4_2023_final.pdf

19. Dirección General de Vigilancia Sanitaria (DGVS). Suben en un 15% las consultas por cuadros respiratorios. 2023. Disponible en: https://dgvs.mspbs.gov.py/suben-en-un-15-las-consultas-por-cuadros-respiratorios/

20. Lovera D, Peralta K, Gonzáles N, Amarilla S, Galeano F, Ayala J, et al. Vigilancia de Infecciones Respiratorias Agudas en niños y adolescentes en un Servicio de Pediatría. Revista del Instituto de Medicina Tropical. el 28 de diciembre de 2023;18(2):37–44. Disponible en: https://doi.org/10.18004/imt/2023.18.2.6

21. Dirección General de Vigilancia Sanitaria (DGVS). Disminuyen en un 20% las consultas por cuadros respiratorios. 2023. Disponible en: https://dgvs.mspbs.gov.py/disminuyen-en-un-20-las-consultas-por-cuadros-respiratorios/

22. Dirección General de Vigilancia Sanitaria (DGVS). Aumenta cifra de hospitalizados por infecciones respiratorias. 2023. Disponible en: https://dgvs.mspbs.gov.py/aumenta-cifra-de-hospitalizados-por-infecciones-respiratorias/

23. Dirección General de Vigilancia Sanitaria (DGVS). Consultas por enfermedades respiratorias muestran ligero aumento. 2023. Disponible en: https://dgvs.mspbs.gov.py/aumenta-cifra-de-hospitalizados-por-infecciones-respiratorias/

24. Dirección General de Vigilancia Sanitaria (DGVS). Demanda de consultas por cuadros respiratorios experimenta nuevo descenso. 2023. Disponible en: https://dgvs.mspbs.gov.py/demanda-de-consultas-por-cuadros-respiratorios-experimenta-nuevo-descenso/

25. Dirección General de Vigilancia Sanitaria (DGVS). Alerta Epidemiológica N° 7. Aumento de Consultas por Enfermedad Tipo Influenza (ETI). 2023 oct. Disponible en:

https://dgvs.mspbs.gov.py/wp-content/uploads/2023/10/Alerta-epidemiologica-aumento-de-Consultas-por-ETI.pdf

26. Gil J, Almeida S, Constant C, Pinto S, Barreto R, Cristino JM, et al. Relevancia a corto plazo de la coinfección viral en pacientes menores de 2 años hospitalizados con infecciones de las vías respiratoriasinferiores. An Pediatr (Engl Ed). marzo de 2018; 88(3): 127–35. DOI: 10.1016/j.anpedi.2017.03.020

27. Esposito S, Daleno C, Prunotto G, Scala A, Tagliabue C, Borzani I, et al. Impact of viral infections in children with community‐acquired pneumonia: results of a study of 17 respiratory viruses. Influenza Other Respir Viruses. el 13 de enero de 2013; 7(1): 18. DOI: 10.1111/j.1750-2659.2012.00340.x

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Publicado

2024-10-31

Número

Vol. 22 Núm. 1 (2024)

Sección

Comunicaciones cortas

Cómo citar

Cáceres Fernández, K., Morales Rivé, R., & Caballero Gómez, S. (2024). Molecular identification of respiratory viruses in Itapúa, Paraguay during the year 2023. Memorias Del Instituto De Investigaciones En Ciencias De La Salud, 22(1). https://doi.org/10.18004/mem.iics/1812-9528/2024.e22162404