Evaluación de metodologías para el análisis de perfil de proteínas secretadas por aislados de Trichoderma spp al medio de cultivo

Autores/as

  • Alberto Cubilla-Ríos Universidad Nacional de Asunción. Facultad de Ciencias Químicas. Departamento de Química Biológica. San Lorenzo, Paraguay
  • María Eugenia Flores Giubi Universidad Nacional de Asunción. Facultad de Ciencias Químicas. Departamento de Química Biológica. San Lorenzo, Paraguay http://orcid.org/0000-0002-1572-9983
  • Javier Enrique Barúa http://orcid.org/0000-0002-8164-3432 http://orcid.org/0000-0002-8164-3432
  • María Cristina Romero Rodríguez Universidad Nacional de Asunción. Facultad de Ciencias Químicas. Departamento de Química Biológica. San Lorenzo, Paraguay http://orcid.org/0000-0001-8120-8986

Palabras clave:

biocontrol, liofilizado, proteínas secretadas

Resumen

Los hongos del género Trichoderma son ampliamente utilizados como agentes de control biológico para controlar diversos fitopatógenos, sin embargo, muchas moléculas implicadas en el biocontrol aún se desconocen. Existen numerosos trabajos en los cuales se evalúan las moléculas secretadas por el hongo, entre las que se encuentran las proteínas. Para evaluar estas moléculas se deben extraer del sistema experimental en el cual crece el hongo, y la metodología de extracción, la cual es altamente dependiente de diversos factores, requiere el ajuste de las condiciones experimentales. Así, se planteó la evaluación de dos metodologías para el análisis del perfil de proteínas secretadas por aislados de Trichoderma spp. al medio de cultivo, partiendo de filtrado sin liofilizar y liofilizado. Los perfiles proteicos obtenidos a partir de material liofilizado, aplicando la precipitación de proteínas con ácido tricloacético en acetona seguida de una limpieza con metanol y cloroformo, generó un perfil adecuado para el análisis de las proteínas secretadas al medio de cultivo.

 

Citas

Baker, K. F. (1987). Evolving concepts of biological control of plant pathogens. Annual Review of Phytopathology, 25, 67–85.

Cubilla-Ríos, A. A., Ruíz-Díaz-Mendoza, D. D., Romero-Rodríguez, M. C., Flores-Giubi, M. E. & Barúa-Chamorro, J. E. (2019).Antibiosis of proteins and metabolites of three species of Trichoderma against paraguayan isolates of Macrophomina phaseolina. Agronomía Mesoamericana, 30(1), 63–77. https://doi.org/10.15517/am.v30i1.34423.

Do Vale, L. H. F., Gómez-Mendoza, D. P., Kim, M. S., Pandey, A., Ricart, C. A. O., Edivaldo, X. F. F. & Sousa, M. V. (2012). Secretome analysis of the fungus Trichoderma harzianum grown on cellulose. Proteomics, 12(17), 2716–2728. https://doi.org/10.1002/pmic.201200063.

Kou, Y. & Naqvi, N. I. (2016). Surface sensing and signaling networks in plant pathogenic fungi. Seminars in Cell and Developmental Biology, 57, 84–92. https://doi.org/10.1016/j.semcdb.2016.04.019.

Laemmli, U. K. (1970). Cleavage of structural proteins during the assembly of the head of bacteriophage T4. Nature, 227(5259), 680–685.

Maldonado, A. M., Echevarría-Zomeño, S., Jean-Baptiste, S., Hernández, M. & Jorrín-Novo, J. V. (2008). Evaluation of three different protocols of protein extraction for Arabidopsis thaliana leaf proteome analysis by two-dimensional electrophoresis. Journal of Proteomics, 71(4), 461–472. https://doi.org/10.1016/j.jprot.2008.06.012.

Mathesius, U., Keijzers, G., Natera, S. H. A., Weinman, J. J., Djordjevic, M. A. & Rolfe, B. G. (2001). Establishment of a root proteome reference map for the model legume. Scanning, 1424–1440.

Souza, M. F. de, Silva, A. S. A. da & Bon, E. P. S. (2018). A novel Trichoderma harzianum strain from the Amazon Forest with high cellulolytic capacity. Biocatalysis and Agricultural Biotechnology, 14(October 2017), 183–188. https://doi.org/10.1016/j.bcab.2018.03.008.

Suárez, M. B., Luis, S., Chamorro, M. I., Rey, M., González, F. J., Llobell, A. & Monte, E. (2005). Proteomic analysis of secreted proteins from Trichoderma harzianum Identification of a fungal cell wall-induced aspartic protease. Fungal Genetics and Biology, 42, 924–934. https://doi.org/10.1016/j.fgb.2005.08.002.

Vargas-Hoyos, H. A. & Gilchrist-Ramelli, E. (2015). Producción de enzimas hidrolíticas y actividad antagónica de Trichoderma asperellum sobre dos cepas de Fusarium aisladas de cultivos de tomate ( Solanum lycopersicum ) Revista Mexicana de Micología, 42, 9–16.

Vinale, F., Sivasithamparam, K., Ghisalberti, E. L., Marra, R., Woo, S. L., & Lorito, M. (2008). Trichoderma-plant-pathogen interactions. Soil Biology and Biochemistry, 40(1), 1–10. https://doi.org/10.1016/j.soilbio.2007.07.002.

Wang, W., Vignani, R., Scali, M. & Cresti, M. (2006). A universal and rapid protocol for protein extraction from recalcitrant plant tissues for proteomic analysis. Electrophoresis, 27(13), 2782–2786. https://doi.org/10.1002/ELPS.200500722.

Wu, X., Gong, F. & Wang, W. (2014). Protein extraction from plant tissues for 2DE and its application in proteomic analysis. Proteomics, 14(6), 645–658. https://doi.org/10.1002/pmic.201300239.

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Publicado

2020-06-30

Cómo citar

Cubilla-Ríos, A. ., Flores Giubi, M. E. ., Barúa, J. E., & Romero Rodríguez, M. C. . (2020). Evaluación de metodologías para el análisis de perfil de proteínas secretadas por aislados de Trichoderma spp al medio de cultivo. Investigaciones Y Estudios - UNA, 11(1), 47-51. Recuperado a partir de https://revistascientificas.una.py/ojs/index.php/rdgic/article/view/14